Un bioinformatiquillo

viernes, 9 de mayo de 2008

Calaméo: convierte tus archivos en publicaciones digitales online

No he podido resistirme a probarlo. Para darle un aspecto mucho más atractivo y llamativo a mis creaciones literarias. Tenéis que pasar la página con el puntero del ratón tal y como lo haríais en un libro real.

Fuente: UbuntuLife

Calameo, es un nuevo servicio online que nos permite subir un fichero a su servidor (admite varios formatos como pueden ser .doc o .pdf) y de manera automatica nos lo convierte a flash en un formato que podemos visualizar con nuestro navegador favorito.

Ejemplo

Visto en | GenBeta

Compiz-Check: Comprueba si puedes ejecutra Compiz Fusion en tu PC

Fuente: UbuntuLife

Compiz-check es un pequeño script que te permite saber si puedes ejecutar Compiz en tu maquina y en caso contrario te propone algunas soluciones.
Instalarlo es muy sencillo:

$ wget http://blogage.de/files/3478/download -O compiz-check

Despues le damos permisos de ejecucion:

$ chmod +x compiz-check

y lo ejecutamos:

$ ./compiz-check

Yo he tenido suerte:

A alguno de vosotros que tengais problemas, tal vez os pueda servir de ayuda.

Visto en | Alexit
Enlace | Planet Compiz Fusion y Forlong

miércoles, 7 de mayo de 2008

Instalar VirtualBox en Ubuntu Hardy Heron

Fuente: UbuntuLife

Muy interesante tip que veo en Unleashed

- Lo primero es instalar los paquetes esenciales que necesitaremos
para construir los modulos que utiliza el nucleo de Virtualbox

$ sudo apt-get install build-essential linux-headers-`uname -r`

- Ahora nos descargamos VirtualBox directamente sin necesidad de utilizar un repositorio:

para i386:

$ wget http://www.virtualbox.org/download/1.5.6/virtualbox_1.5.6-28266_Ubuntu_hardy_i386.deb ; sudo dpkg -i virtualbox_1.5.6-28266_Ubuntu_hardy_i386.deb

para amd64:

$ wget http://www.virtualbox.org/download/1.5.6/virtualbox_1.5.6-28266_Ubuntu_hardy_amd64.deb ; sudo dpkg -i virtualbox_1.5.6-28266_Ubuntu_hardy_amd64.deb

- Ahora añadimos nuestro usuario al grubo “vboxusers”:

$ sudo adduser $USER vboxusers Adding user `jose’ to group `vboxusers’ … Adding user jose to group vboxusers Done.

- Ahora habilitamos el soporte USB para VirtualBox.
Por defecto USB esta deshabilitado. Seguramente quieras habilitarlo y evitar
un error que aparece al entrar en la Configuracion de nuestra maquina virtual.
Para habilitar USB edita el archivo mountdevsubfs.sh:

$ sudo gedit /etc/init.d/mountdevsubfs.sh

Veras un bloque de codigo con un aspecto similar a este:

# # Magic to make /proc/bus/usb work # #mkdir -p /dev/bus/usb/.usbfs #domount usbfs “” /dev/bus/usb/.usbfs -obusmode=0700,devmode=0600,listmode=0644 #ln -s .usbfs/devices /dev/bus/usb/devices #mount –rbind /dev/bus/usb /proc/bus/usb

Ahora descomenta las 4 ultimas lineas, debe quedar como:

# # Magic to make /proc/bus/usb work # mkdir -p /dev/bus/usb/.usbfs domount usbfs “” /dev/bus/usb/.usbfs -obusmode=0700,devmode=0600,listmode=0644 ln -s .usbfs/devices /dev/bus/usb/devices mount –rbind /dev/bus/usb /proc/bus/usb

Ahora cerramos la sesion haciendo un logout. y volvemos a iniciar una sesion
para que los cambios que hemos hecho sobre nuestro usuario añadiendolo al
grupo vboxusers se hagan efectivos.

Si de todas formas los pasos anteriores no funcionan, y el usb no se
habilita, puedes intentar lo siguiente.

- obten el identificador el grupo vboxusers

$ grep vbox /etc/group vboxusers:x:124:jose
Aqui en nuestro caso seria el valor 124.

Ahora editamos el fichero fstab y añadimos el valor de ese id.

sudo gedit /etc/fstab

## usbfs is the USB group in fstab file: none /proc/bus/usb usbfs devgid=124,devmode=664 0 0

Hacemos lo mismo con el fichero mountdevsubfs.sh

$ sudo gedit /etc/init.d/mountdevsubfs.sh

## Mount the usbfs for use with Virtual Box domount usbfs usbdevfs /proc/bus/usb -onoexec,nosuid,nodev,devgid=124,devmode=664

Ahora reiniciamos, y virtualbox deberia detectar nuestros dispositivos usb.

martes, 6 de mayo de 2008

Elimina el tiempo de espera para instalar extensiones de Firefox

Fuente: BeLinuxMyFriend

Puedes configurar Firefox para que el contador de tiempo de instalación de complementos deje de existir, o para que todos no entendamos; que no haya cuenta atrás (ver imagen).
Necesitamos abrir la configuración de Firefox (copia "about:config" en la barra de dirección), buscar en la barra de Filtro; "security.dialog_enable_delay" y poner como valor "0" (clicando dos veces sobre él). Desde ese momento dejara de aparecer la cuenta regresiva en el boton de "instalar" ;)

Enlace: How to Skip the Installation Delay for Firefox Extensions [How To] [Lifehacker]

lunes, 5 de mayo de 2008

¿Qué es el software libre?

El lunes lunes al llegar a la facultad ví un cartel que me llamó la atención. La conferencia se titulaba "Software Libre y Ciencia", si en el cartel aparecía la mascota del GNU, no pude resistirme a asistir.

Más que nada, consistio en un repaso más filosófico y anectotado que otra cosa, donde se trataron aspectos muy interesantes. Pero el motivo por el cual escribo un post es porque la conferencia me abrió los ojos sobre el concepto de software libre el cual, si leéis estas palabras, seguro que necesitáis conocer más a fondo o refrescarlo. No es un concepto que se definiera al tuntún por cuatro frikis, sino que fue una cosa mucho más seria y estudiada, realizada con la colaboración de abogados. Tampoco es

En Wikipedia, tenemos mucha más información.

Seguimos informando. Un saludo linuxero.

domingo, 4 de mayo de 2008

OpenOffice 1 - Olga 0

La suite OpenOffice está muy bien, pero mi nivel de meticulosidad me hace abrazar otras alternativas más específicas y con resultados más profesionales como son LyX (para textos y presentaciones) y GNUmeric (para hojas de cálculo). A pesar de ello, nunca rechazo ayudar a los que usan software libre, ni mucho menos a los amigos.

El viernes Olga me comentó que la barras de tareas de OpenOffice le resultaba molestamente grande y quería hacerla más pequeña. Entonces, haciendo alarde de frikismo, le comenté que seguro que tenía arreglo que en el peor de los casos en la carpeta .OpenOffice del directorio personal habría un archivo de configuración en el que en lugar de poner 100, pusieramos 50.

Pero googleando un par de minutos di con una solución mucho más sencilla. En Herramientas–> Opciones y dentro de la opción "Ver" podemos cambiar tanto el tamaño de los iconos como el tema de los mismos. Además en este menú opciones hay muchos otros parámetros de configuración interesantes, los cuales os aconsejo observar si usáis la suite.

Porque el software libre puede ser maravilloso...

Adaptador wifi USB Conceptronic c54ru funciona directamente en Ubuntu Hardy Heron

Ya para la versión 7.10 de Ubuntu, me hice eco de un tutorial para instalar los drivers del adaptador wifi USB Conceptronic c54ru. Pues bien, decidí instalar Xubuntu 8.04 RC en mi K7 y nada más iniciar el LiveCD me reconoció el dispositivo, aunque no me rastreaba la red eficazmente. Una vez ya instalado, todo funcionaba a la perfección y sin instalar nada adicional. Si tenéis uno de estos, os recomiendo que lo concectéis durante la instalación para que el instalador os lo reconozca.

Ubuntu me gusta cada vez más. Cada día mejor.

sábado, 3 de mayo de 2008

Gsopcast: Todos los deportes gratis desde internet

Fuente: Karlinux

Bueno realizo este post para aquellos que os guste ver la tele por internet y más en cuestión los partidos de pago de las diferentes ligas.

Existe un programa para realizar tales propósitos este se llama sopcast

Para instalarlo en Ubuntu Gutsy es verdaderamente fácil:

Descargarmos el archivo que hay abajo en el icono de Descarga

Lo instalamos con Gdebi. Una vez instalado queda alojado en Aplicaciones - Sonido y Video - gsopcast

ASIGNAMOS PRTOCOLO SOP EN FIREFOX:

en la barra de direcciones teclea la dirección: about:config

-Boton derecho sobre la página Nuevo/logico

Nombre: network.protocol-handler.external.sop

Valor: True

-Boton derecho sobre la página Nuevo/cadena

Nombre: network.protocol-handler.app.sop

Valor: /usr/local/bin/scriptsopcast.sh

Ahora creamos el script (scriptsopcast.sh) en un terminal ponemos la siguiente orden:

gedit scriptsopcast.sh

Copiamos y pegamos lo siguiente:

#!/bin/sh
sp-sc $1 8000 9000 &
sleep 30
vlc http://localhost:9000/tv.asf
killall sp-sc
killall vlc
Nota el programa vlc se puede cambiar por cualquier otro: xine o mplayer

Guardamos y cerramos.

Lo copiamos a la ruta especificada arriba, en el mismo terminal introducimos lo siguiente:

sudo cp scriptsopcast.sh /usr/local/bin/scriptsopcast.sh

Le damos permisos de ejecución, mediante el comando

sudo chmod 777 /usr/local/bin/scriptsopcast.sh

Ahora cuando vayais a alguna página como rojadirecta ver el partido que queremos ver, y pulsar sobre el enlace y entonces se abrirá un cuadro de dialogo sobre el programa a abrir, y pondrá scriptsopcast.sh, pero al parecer no deja seleccionarlo por lo que tendreis que clickear a elegir y buscar la ruta indicada /usr/local/bin/ y entonces ahí vereis scriptsopcast.sh seleccionarlo y entonces si que nos dejará elegir

Ahora tardará 30 segundos en abrir, según me cuentan para cargar el buffer y cuando sales cierra todas las aplicaciones.

Sinplemente genial y gracias a eldeberde

Para más información del propio foro de rojadirecta si no os funciona aquí

viernes, 2 de mayo de 2008

Previsualización de archivos de música en nautilus

Allá por los comienzos de este blog, ya me hice eco de la posibilidad de reproducir los archivos de música directamente colocando el ratón sobre el archivo. En la anterior versión de Ubuntu (Gutsy Gibbon) este tip no funcionaba. Menos mal que ahora podemos disfrutar de este tip. En mi caso con la instalación de Hardy Heron, se me instaló, pero si no es el caso tipear: