miércoles, 31 de octubre de 2007

Gimmie, organizador del escritorio Gnome

Fuente: BeLinuxMyFriend

Gimmie es un panel avanzado, especialmente diseñado para GNOME. Lo puedes usar en Ubuntu Gutsy Gibbon, ya que esta incluido en sus repositorios.

# sudo aptitude install gimmie

Entre las características que podemos encontrar en en Gimmie, están:

  • Instalar programas
  • Ver dispositivos conectados
  • Abrir y grabar CDs y DVDs
  • Compartir archivos en red
  • Controlar impresoras
  • Configurar las preferencias de sistema
  • Configurar las herramientas administrativas
  • Marcar carpetas como favoritas
  • Abrir y crear documentos
  • Organizar y crear notas para Tomboy
  • Abrir archivos de Audio
  • Abrir películas
  • Descargar archivos
  • Grabar Emails
  • Ver tus contactos de mensajería instantánea

.- Como ejecutar

Puedes tener todo realmente ordenado, simplemente añadiendo al panel GNOME un applet (complemento):

Botón derecho del ratón encima del panel, y seleccionamos la opción; "Añadir al panel...". Una vez abierta la ventana buscaremos "Gimmie" dentro de la categoría "Utilidades".


.- Una vez ejecutado
Al ejecutar Gimmie nos aparecerán cuatro pestañas; Linux, Programas, Biblioteca y Gente.

Pestaña Linux
En esta pestaña podemos encontrar todo lo relacionado con los archivos/carpetas del sistema, dispositivos, ubicaciones y configuración de sistema.


  • Todos los favoritos
  • Usados recientemente
  • Lugares
  • Dispositivos y medios
  • Equipos en las proximidades
  • Impresoras
  • Configuración

Pestaña Programas
Encontraremos todo lo que tiene que ver con las aplicaciones y utilidades instaladas.


  • Documentos abiertos recientemente
  • Accesorios
  • Gráficos
  • Internet
  • Juegos
  • Oficina
  • Sonido y vídeo
  • Otros

Pestaña Biblioteca
Documentos recientes, archivos de audio, imágenes y lugares donde encontrarlos.


  • Recientemente usado
  • Documentos
  • Notas
  • Música y películas
  • Fotos de Flickr
  • Google Office
  • Descargas
  • Adjuntos

Pestaña Gente
Todo lo que tiene que ver con contactos y comunicación en general.


  • Gente reciente
  • Conectados ahora
  • Todos
  • GMail
  • Friendster
  • Usuario

.- Preferencias
Clicando con el botón derecho del ratón encima de cualquiera de las pestañas, podemos entrar en las preferencias de Gimmie (Preferences)

En ellas podemos seleccionar los temas a mostrar (los anteriormente descritos) y seleccionar el aspecto (botones solo texto, solo iconos o ambos). También podemos activar o desactivar la opción "Show topic colors" con la que relacionaremos un color con cada pestaña del menú.

Instalar drivers fglrx 8.42.3 para ATI con soporte AIGLX

Fuente: MundoGeek

Ya están disponibles los nuevos drivers fglrx 8.42.3 para tarjetas gráficas ATI que permite al fin utilizar Compiz Fusion usando AIGLX en lugar de XGL. Existen bugs y aunque con estos drivers deberíamos obtener mejor rendimiento, algunas personas han tenido problemas precisamente en la lentitud en 2D; pero si quieres instalarlo, aquí tienes las instrucciones.

Lo primero que vamos a hacer es desinstalar XGL si lo estábamos utilizando:

sudo aptitude purge xserver-xgl

Y desactivar, si lo activamos en su día, la versión del driver fglrx de Ubuntu Gutsy Gibbon (o nuestra distro basada en Debian):

sudo aptitude purge xorg-driver-fglrx

Descargamos el instalador de la nueva versión: Driver ATI fglrx 8.42.3

Le damos permisos de ejecución:

chmod +x ati-driver-installer-8.42.3-x86.x86_64.run

Podemos ejecutar el instalador directamente, o crear un paquete para poder reinstalarlo / desinstalarlo fácilmente después. Para el primer caso, lo ejecutamos seleccionando una instalación automática.

sudo ./ati-driver-installer-8.42.3-x86.x86_64.run

Si queremos generar un paquete primero llamaremos al ejecutable con el flag --listpkg para ver los tipos de paquete disponibles.

./ati-driver-installer-8.42.3-x86.x86_64.run --listpkg

y después --buildpkg con el tipo de paquete que queramos generar. Por ejemplo en mi caso, para Ubuntu Gutsy:

sudo ./ati-driver-installer-8.42.3-x86.x86_64.run --buildpkg Ubuntu/gutsy

Instalar el paquete es tan sencillo como hacer doble clic sobre el paquete cuyo nombre comienza con xorg-driver-fglrx_8.42.3

Si no teníais la versión de fglrx por defecto instalada y habilitada tenéis que activarla en Sistema -> Administración -> Gestor de controladores restringidos (Ubuntu).

Ahora ya podemos editar xorg.conf y borrar al fin las líneas que desactivan Composite y AIGLX :)

sudo gedit /etc/X11/xorg.conf

Busca líneas como

Option "Composite" "0"
Option "Composite" "Disable"
Option "AIGLX" "off"

y borralas.

Por último añadimos el driver fglrx a la lista blanca de drivers con soporte AIGLX en Compiz Fusion editando el archivo correspondiente

sudo gedit /etc/xdg/compiz/compiz-manager

y añadiendo una línea

WHITELIST="fglrx"

Gracias a nightrain en los comentarios de "The Composite extension is not available" en Ubuntu, con ATI por avisar de la nueva versión del driver.

Vídeo como fondo de estritorio



Poner un video como fondo de pantalla en el Escritorio

Estos dias los estoy pasando en casa de mi padre. Aqui, Mi conexion es muy lenta pero esto tenia que comentarlo pues esta genial.

Con cosillas como esta, Linux cada vez me gusta mas.

Si hace unos dias te comente como poner un screensaver como fondo de pantalla, ahora veremos como poner un video.

Este pequeño truco te puede venir bien si estas trabajando pero te apetece ir viendo una pelicula a la vez por ejemplo.

La idea es reproducir un video que se queda como fondo de escritorio.

Yo lo he usado en el equipo que tengo en casa de mi padre,como el equipo es muy viejo,y no tiene muchos recursos, en este equipo tengo instalado Fluxbox, asi que no quiero mojarme diciendo que te funcionara en Gnome o KDE, pues no he podido probarlo, pero tampoco pierdes nada por intentarlo.

Para poner un video como fondo de escritorio basta con ejecutar el siguiente comando:

mplayer -x -y -rootwin

Ejemplo:

$ mplayer -x 1024 -y 800 -rootwin "./mispelis/dragonball01.avi"

Nota: 1024 y 800 son las dimensiones de mi pantalla (la resolucion), ahi tu debes poner las que quieras utilizar.

Aqui os dejo unos pantallazos que fui sacando de mi escritorio FluxBox, a partir de un episodio de Dragon Ball:

video_en_escritorio01.jpg

video_escritorio02.jpg

Si en cambio queremos reproducir la pista de un DVD de video seria:

$ mplayer dvd:// -rootwin

Ejemplo:

$ mplayer -x 1280 -y 1024 dvd://1 -rootwin

video01.jpg

Lo dicho!!. Esta genial, esto mismo lo hice hace tiempo con el VideoLan (VLC) de Windows, pero por desgracia el VLC de Linux no lleva esta funcion.

Que deciros!. mola… para ir siguiendo a ratos una peli, o para enseñarselo a algun amiguete de Windows.

Y si poneis ciertas peliculas (que no puedo nombrar aqui por ser horario infantil) ya ni te cuento, jeje xD

Sobre Fluxbox, es otro entorno de escritorio para equipos con muy pocos recursos. Yo llevo usandolo un par de semanas en el trabajo y me parece muy bueno. Si tienes un buen equipo casi que no te merece la pena pues preferiras usar otros como Gnome o Kde pues es algo raro de configurar al principio (no tiene iconos en el escritorio, no tiene paneles, etc… sino que tienes que editar un fichero tu mismo para configurarlo).

De todas formas hablare pronto de el (un analisis mas amplio para ver como configurarlo, y personalizarlo un poco poniendo nuestro propio fondo de pantalla,etc..)

De momento, Para instalarlo puedes, ejecutar:

$ sudo apt-get install fluxbuntu (la proxima vez que inicies sesion tendras la opcion de arrancar con el)

o bien, descargarte Fluxbuntu (que es una distribucion de ubuntu pero empleando como gestor de escritorio Fluxbox). Sin embargo ahora mismo no es descargable pues estan actualizando la version para que emplee Ubuntu Gutsy (deberas esperar 6 dias).

fluxbuntu-710-screenshot3r.png

martes, 30 de octubre de 2007

Instalar Ubuntu 7.10 en un lápiz USB

Fuente: BeLinuxMyFriend

Hace un tiempo que estaba buscando un manual como este para poder dar más utilidad a mi lápiz.

Para llevar a cabo este Howto, solo hace falta seguir 17 pasos (21 en la fuente original) y tener en cuenta 4 requisitos mínimos.

Requisitos:

  • Ubuntu7.10.ISO * si ya lo tienes en un cd-rom no hace falta.
  • CD Burner/Recorder (Para grabar la .iso en el CD)
  • Pendrive de 1Gb USB flash drive (recomendado 2Gb)
  • u7fixit.tar

PyTube: Alternativa para descargar vídeos de YouTube

Ya hablemos de QTTube un programa para bajar vídeos del YouTube. Ahora traigo otra alternativa. Su nombre es PyTube, que además nos permite cambiar de formato. Aquí tenéis dos informaciones de dos fuentes distintas.

Fuente: OpenGamer
Hoy en dia ya existen decenas de programas para descargar videos de Youtube.

Pero que pasa cuando quieres codificarlo para subirlo a otro servicio o tenerlo en tu reproductor de videos favorito?. Pues hay que descargar e instalar otro programa.

Por suerte en Linux encontre una excelente herramienta para descargar y codificar videos con un solo clic.

Pytube se encargara de descargarlo y te da la posibilidad de codificarlo en los formatos :

  • .ogm
  • .mpg
  • .avi
  • .flv
  • .mp3
  • .ogg
  • .wav

Bastara con introducir la direccion completa del video, elegir el formato y la carpeta donde queremos que el video se guarde y listo.

pytube.jpg

Un globo de alerta de avisara que se esta haciendo y este se cerrara cuando todo el proceso ya este completo:

pytube1.jpg

Puede ser descargado desde aqui:

Descargar pytube

Y funciona perfectamente en Ubuntu 7.04 y 7.10



Fuente: Blog Ubuntu El Salvador

Es otra aplicación es mas robusta, bueno el programa se llama PyTube entre las ventajas que tiene estan:

  • Descarga a tu disco duro convirtiéndolo directamente al formato que tú elijas: AVI, MPG, OGM, FLV. O incluso a formatos de audio: MP3, OGG, WAV.
  • Te permite elegir un fichero de video/audio local, uno que ya tengas en tu disco duro, y no directamente del portal Youtube, por lo que también sirve como un estupendo y sencillo conversor entre formatos de video.

Un par de imagenes pytube1pytube2

Para instalarlo pues descargar el archivo deb desde aqui, o agregarlo en los repositorios, creo que descargar e instalar el deb no tendras problemas, para el segundo metodo abre una terminal y digita la siguiente linea:

sudo gedit /etc/apt/sources.list

ahora digita en el fichero: deb http://www.bashterritory.com/pytube/releases /

luego guardas el archivo y en la consola digita sudo aptitude update por ultimo instalas la aplicacion con la siguiente linea:

sudo apt-get install pytube despues de esto ya lo tendras instalado en el menu Aplicaciones > Sonido y video > Pytube, solo lo he probado en Feisty pero me imagino tambien funciona en Gusty, si alguien lo prueba en gusty favor me comenta.

Edito:

Ya se corroboro que tambien funciona en Gusty

lunes, 29 de octubre de 2007

Acelerar la carga de OpenOffice

Fuente: EntreTuxesYPepinos

Sin duda una pega considerable de usar OpenOffice es su laaaaaaaaaaargo tiempo de carga. Con este tip vamos a ver cómo acelerar ese proceso de carga válido para todas las aplicaciones de OpenOffice.org.

Es muy simple. Abrid una de las aplicaciones de OpenOffice que están en “Aplicaciones > Ofimática“. Una vez abierta id a “Herramientas > Opciones”. Nos encontramos con un menú a la izquierda, vamos a “OpenOffice.org > Memoria de trabajo“:

Bien, ahora a la derecha tenemos varias opciones con sus valores. Esto es lo que tenemos cambiar para acelerarlo. Hay que decir que esto provocará un mayor consumo de memoria, pero en principio tampoco será excesivo. Por si acaso, guardad los valores originales por si no os sintiérais conformes con el rendimiento.

Esto es lo que tenemos que cambiar:

  • Cantidad de pasos: 30
  • Usar para OpenOffice.org: 128
  • Memoria por objeto: 20
  • Cantidad de objetos: 20

Al cabo de un rato largo abrid de nuevo la misma aplicación y comprobad que el tiempo de carga es considerablemente mejor.

Monitoriza el consumo de recursos de tu máquina con GKrellM

gkrellm1.jpg

Un usuario de esta web (LinuxM@n) me escribe y me comenta acerca de esta aplicacion. Yo no la conocia, asi que os comento brevemente en que consiste.

GKrellm, es un pequeño gadget (al estilo de los screenlets o widgets) que se coloca sobre nuestro escritorio y que proporciona informacion sobre el consumo de la memoria, el porcentaje de utilizacion de la CPU y otras variables del sistema.

Para instalarlo ejecuta el siguiente comando desde consola:

$ sudo apt-get install gkrellm

Para ejecutarlo:

$ gkrellm &

Puede personalizarse facilmente descargando temas en formato .tar.gz y descomprimiendolos en el directorio Home del usuario, en la carpeta .gkrellm2/themes

LinuxM@n / Axel me ha dejado por correo unos temas de ejemplo que el mismo ha realizado. Son los siguientes (como me comenta por correo):

eganthemes.jpg

1) Egan_2.tar.gz: Este tema esta basado en el Egan. Lo que pasa es que el Egan no me terminaba de gustar para el escritorio de Ubuntu, por lo tanto lo que hice fue adaptar el tema Egan a los colores de las ventanas de Ubuntu con el tema Human.

2) Egan_2a.tar.gz: Este tema esta basado en Egan_2 y tiene 7 alternativas diferentes… Con mirar un poco veras las diferencias entre alernativa y alternativa. Este es el que mas trabajo me dio.
De 0 a la 3 son iguales que del 4 a la 7 pero sin el titulo. Sin duda los que mas le gustara a los que tengan el tema Human de Ubuntu sera el 3 y el 7. A mi en particular me gusta el 7!!!

3) Egan_2a_glass.tar.gz: Este es el tema que yo uso… Es totalmente transparente. Tiene solo 1 alternativa y es con un pequeño marco de 3 pixels

Me ha enviado tambien unos temas para Pidgin (gracias de nuevo, Axel) pero esos ya os los comentare en otro proximo post.

Puedes descargarte estos temas para GKrellm en los siguientes enlaces:

Tema Egan Ubuntu
Tema Egan_2
Tema Egan_2a
Tema Egan_2aglass

Imagina que quisieramos instalar el ultimo de ellos (el transparente). Nos descargamos el fichero: Egan_2a_glass.tar.gz. Lo copiamos a nuestro directorio home a la carpeta donde GKrellm deja los temas, en mi caso haria:

$ cp Egan_2a_glass.tar.gz /home/jose/.gkrellm2/themes (tu copialo a el directorio home de tu usuario)

Lo descomprimo:

$ gunzip Egan_2a_glass.tar.gz (para obtener el .tar)

y despues:

$ tar -xvf gunzip Egan_2a_glass.tar (para descomprimir el tar)

Con eso ya se me crea la estructura de directorios del tema en la carpeta destino y ya puede ser usado desde la aplicacion.
Una vez instalados los temas si haces click derecho sobre la parte superior de el widget en el escritorio, aparece su menu de configuracion. En el apartado Tema, ya debe aparecerte el nombre de los que acabas de instalar y te permite seleccionarlo, tal que al seleccionarlo, de manera inmediata se aplica la piel (skin) sobre GKrellm.

que los disfruteis!!

APT en Firefox

domingo, 28 de octubre de 2007

Buscar y eliminar ficheros duplicados

Completa lista de repositorios para Ubuntu 7.10

Un listado muy completo para instalar aplicaciones extraido desde Ubuntu-es. Importante y como comentan: “Usalo bajo tu propio riesgo pues podrian existir problemas con los paquetes ya instalados”.

#
# Sorces.list hecho por CATRIP para Ubuntu 7.10 Gutsy Gibbon
#
# IMPORTANTE: USALO BAJO TU PROPIO RIESGO, YA QUE PUEDEN EXISTIR PROBLEMAS CON LOS PAQUETES
# LO HE ESTADO TESTEANDO Y HASTA EL MOMENTO TODO FUNCIONA PERFECTAMENTE.
#
# NOTA:
# Para cada repositorio he colocado las instrucciones para agregar su respectiva llave, lo único
# que tienes que hacer es copiar cada instrucción para el repositorio que quieras agregar.
#
# Existe un repositorio para tarjetas de video SiS, por lo pronto, este no funciona a la perfección,
# y solo debe ser desmarcado y utilizado si tu tarjeta de video es SiS, de lo contrario puedes dejarlo
# tal cual como está, o eliminarlo.
#
# Espero que te sirva, este trabajo, y si piensas modificarlo o redistribuirlo no hay problema, solo ponme como
# origen del sources.list
# Paquetes soportados de Ubuntu
# Instalación de la Llave:
# gpg --keyserver subkeys.pgp.net --recv 437D05B5
# gpg --export --armor 437D05B5 | sudo apt-key add -
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy main restricted
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-updates main restricted
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-security main restricted
deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy main restricted
deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-updates main restricted
deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-security main restricted
# Paquetes soportados por la comunidad Ubuntu
# Instalación de la Llave:
# gpg –keyserver subkeys.pgp.net –recv 437D05B5
# gpg –export –armor 437D05B5 | sudo apt-key add -
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy universe multiverse
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-updates universe multiverse
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-security universe multiverse
deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy universe multiverse
deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-updates universe multiverse
deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-security universe multiverse
# Ubuntu backports project
# Instalación de la Llave:
# gpg –keyserver subkeys.pgp.net –recv 437D05B5
# gpg –export –armor 437D05B5 | sudo apt-key add -
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-backports main restricted universe multiverse
deb-src http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-backports main restricted universe multiverse
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ gutsy-proposed restricted main multiverse universe
# EMESENE
deb http://apt.emesene.org/ ./
deb-src http://apt.emesene.org/ ./
# CANONICAL COMMERCIAL REPOSITORY (Hosted on Canonical servers, not Ubuntu servers.
# RealPlayer10, Opera, VmWare Server and more to come.)
deb http://archive.canonical.com/ubuntu gutsy partner
#Free fonts for Ubuntu Gutsy Gibbon
deb http://ppa.launchpad.net/corenominal/ubuntu gutsy main
deb-src http://ppa.launchpad.net/corenominal/ubuntu gutsy main
# SiS repository for SiS VGA Cards
#deb http://www.winischhofer.net/sis/debian/unstable ./
#deb-src http://www.winischhofer.net/sis/debian/unstable ./
#Ubuntu with KDE4 icons
deb http://download.tuxfamily.org/oxygenrefit/OxyRepo/ nebula main
#AUTOMATIX REPOS START
deb http://www.getautomatix.com/apt gutsy main
deb http://security.ubuntu.com/ubuntu gutsy-security main restricted universe multiverse
#AUTOMATIX REPOS END
# Medibuntu - Ubuntu 7.10 “gutsy gibbon”
# Please report any bug on https://bugs.launchpad.net/medibuntu/
# Instalación de la Llave:
# wget -q http://packages.medibuntu.org/medibuntu-key.gpg -O- | sudo apt-key add -
deb http://packages.medibuntu.org/ gutsy free non-free
deb-src http://packages.medibuntu.org/ gutsy free non-free
# Upstream Wine
# Instalación de la Llave:
# gpg –keyserver subkeys.pgp.net –recv 387EE263
# gpg –export –armor 387EE263 | sudo apt-key add -
deb http://wine.budgetdedicated.com/apt gutsy main
# Elisa Debian Packages
deb http://elisa.fluendo.com/packages gutsy main
# Iuculano’s debian packages
# Instalación de la Llave:
# gpg –keyserver subkeys.pgp.net –recv AE3BE9AA
# gpg –export –armor AE3BE9AA | sudo apt-key add -
deb http://ubuntu.iuculano.it gutsy all
deb-src http://ubuntu.iuculano.it gutsy all
# Ryan Kavanagh packages
# Instalación de la Llave:
# gpg –keyserver subkeys.pgp.net –recv 02544D0E
# gpg –export –armor 02544D0E | sudo apt-key add -
deb http://packages.ryanak.ca ryan-gutsy all
deb-src http://packages.ryanak.ca ryan-gutsy all
# Le depomaniak repository
# Instalación de la Llave:
# gpg –keyserver subkeys.pgp.net –recv 1D59E694
# gpg –export –armor 1D59E694 | sudo apt-key add -
deb http://ubuntu.davromaniak.eu gutsy-depomaniak all
deb-src http://ubuntu.davromaniak.eu gutsy-depomaniak all
# syzygy42 repository avant window navigator, exaile, closure
# Instalación de la Llave:
# wget http://download.tuxfamily.org/syzygy42/reacocard.asc -O- | sudo apt-key add -
deb http://download.tuxfamily.org/syzygy42/ gutsy all
deb-src http://download.tuxfamily.org/syzygy42/ gutsy all
# The Ubuntu NLP Repository
# Instalación de la Llave:
# gpg –keyserver subkeys.pgp.net –recv 8ABD1965
# gpg –export –armor 8ABD1965 | sudo apt-key add -
deb http://cl.naist.jp/~eric-n/ubuntu-nlp gutsy all
deb-src http://cl.naist.jp/~eric-n/ubuntu-nlp gutsy all
# Debuntu Ubuntu Gutsy packages
# Instalación de la Llave:
# wget http://repository.debuntu.org/GPG-Key-chantra.txt -O- | sudo apt-key add -
deb http://repository.debuntu.org/ gutsy multiverse
deb-src http://repository.debuntu.org/ gutsy multiverse
# Cafuego Gutsy Stuff: Broadcom firmware google-earth secondlife
# Instalación de la Llave:
# wget http://debian.cafuego.net/AF425CB5.gpg -O- | sudo apt-key add -
deb http://au.ubuntu.cafuego.net gutsy-cafuego all
deb-src http://au.ubuntu.cafuego.net gutsy-cafuego all
# gnomemeeting - ekiga
# Instalación de la Llave:
# gpg –keyserver subkeys.pgp.net –recv 52ABFCB1
# gpg –export –armor 52ABFCB1 | sudo apt-key add -
deb http://snapshots.ekiga.net/ubuntu/ gutsy main
deb-src http://snapshots.ekiga.net/ubuntu/ gutsy main
# Ubuntu repository for Screenlets
# Instalación de la Llave:
# wget http://hendrik.kaju.pri.ee/ubuntu/hendrikkaju.gpg -O- | sudo apt-key add -
deb http://hendrik.kaju.pri.ee/ubuntu/ gutsy screenlets
# Ekiga and Debian pkg-voip
deb http://pkg-voip.buildserver.net/ubuntu gutsy main
# The repository from Kubuntu Germany
# Instalación de la Llave:
# wget http://archive.czessi.net/ubuntu/kczessi.gpg –quiet -O - | sudo apt-key add -
deb http://archive.czessi.net/ubuntu gutsy main restricted universe multiverse preview
deb-src http://archive.czessi.net/ubuntu gutsy main restricted universe multiverse preview
# Ubuntu backports project
# Instalación de la Llave:
# gpg –keyserver subkeys.pgp.net –recv 437D05B5
# gpg –export –armor 437D05B5 | sudo apt-key add -
deb http://mi.mirror.garr.it/ubuntu gutsy-backports main restricted universe multiverse
deb-src http://mi.mirror.garr.it/ubuntu gutsy-backports main restricted universe multiverse

sábado, 27 de octubre de 2007

Zatoo:Televisión por internet

Fuente: BeLinuxMyFriend

Había leído ya al respecto, pero no fue hasta que leí un articulo en Sin Miedo, que me decidí a probarlo.



Zattoo es una aplicación para poder ver la televisión vía internet de manera fácil y gratuita, usando para ello la tecnología el p2p. Dispone de de 14 canales gratuitos de los cuales 9 son españoles (La 1, La 2, La Sexta, TeleDeporte, Canal 24, Antena 3, Telecinco, Cuatro y Extremadura TV).

Para poder usar/descargar Zattoo necesitas registrarte en su web. Una vez registrado puede descargar la versión que más te interese (incluidas; Mac, Windows, Windows Vista y Linux).

Una vez descargado el archivo .deb, simplemente lo instalaremos:

Herramientas de sistema > Instalador de paquetes GDebi

Y ejecutamos:

Sonido y video > Zattoo Player

Ahora ya lo tenemos abierto y podemos introducir los datos que se nos piden (que son los mismos que usamos al registrarnos en la página web):

Zattoo > Login...


Una vez hecho esto, simplemente disfrutaremos del espectáculo.

Escuchar radio de manera online en Ubuntu: Script arreglado

Krawler ha dado solución al script de la entrada "Escuchar radio de manera online en Ubuntu":

Bueno he estado leyendo y analizando el scripts e visto cual podria ser la razon por la cual no te funciona, me imagino que a todos si no entendeis mucho os dara este error
radio.sh: 32: Syntax error: "(" unexpected
la solucion es muy sencilla editamos el scripts y en lalinea 32 veras esto function Emisora()
muy bien pues solo teneis que añadirle esto y ponerlo asi
function Emisora"()" ponerle las comillas y listo ya os funcionara...

Ya he modificado la entrada. Espero que os vaya bien.
Gracias a Krawler por su atención.

Cappuccino: precisamente me has pillado compilando una cosilla

Fuente: UbuntuLife

cappuccino.jpg

Cappuccino es un pequeño “toy” que lo unico que hace es engañar a tu jefe haciendole pensar que trabajas muy duro. De poca utilidad o puede que no, ¿quien sabe?…

Para instalarlo ejecuta:

$ sudo apt-get install cappuccino

Lo arrancas con:

$ cappuccino

puede que te saque de algun apuro…

Pdftk: modificación de ficheros en pdf

He encontrado una utilidad para modificar ficheros en formato pdf. Se llama Pdftk y se gestiona por medio de la consola o de forma gráfica mediante Guipdftk (que no he conseguido instalar en Ubuntu). Este programa nos permite realizar las siguientes acciones:

* Unir documentos en pdf.
* Dividir páginas en un documento nuevo.
* Rotar documentos en pdf o páginas.
* Desencriptar el documento (requiere contraseña).
* Encriptar el documento como se quiera.
* Rellenar formas con datos en X/FDF o aplanar formas.
* Generar plantillas de datos en FDF.
* Aplicar una marca de agua o un sello.
* Informar de la métrica y los marcadores.
* Actularizar metadatos del pdf.
* Adjuntar ficheros a páginas del pdf o al documento íntegro.
* Separar ficheros adjuntos
* Separar un pdf en páginas sueltas
* Comprimir o volver a comprimir.
* Reparar documentos corruptos si es posible.

Ejemplos prácticos

Unir dos o más PDFs en un documento nuevo

pdftk 1.pdf 2.pdf 3.pdf cat output 123.pdf

o (usando variables):

pdftk A=1.pdf B=2.pdf cat A B output 12.pdf

o (usando comodines):

pdftk *.pdf cat output combined.pdf

Separar páginas seleccionadas de varios PDFs a un documento nuevo

pdftk A=one.pdf B=two.pdf cat A1-7 B1-5 A8 output combined.pdf

Cifrar un documento usando 128-Bit (predeterminado) y retener todos los permisos (predeterminado)

pdftk mydoc.pdf output mydoc.128.pdf owner_pw foopass

Igual que lo anterior, exigiendo además una contraseña para abrir el PDF

pdftk mydoc.pdf output mydoc.128.pdf owner_pw foo user_pw baz


Igual que lo anterior permitendo la impresión (una vez que el PDF está abierto)

pdftk mydoc.pdf output mydoc.128.pdf owner_pw foo user_pw baz allow printing

Desencriptar un pdf

pdftk secured.pdf input_pw foopass output unsecured.pdf

Unir dos archivos, de los cuales uno está cifrado (el archivo resultante no está encriptado)

pdftk A=secured.pdf mydoc.pdf input_pw A=foopass cat output combined.pdf

Descomprimir los flujos de página para editar el código PDF en un editor de texto

pdftk mydoc.pdf output mydoc.clear.pdf uncompress

Reparar una tabla XREF o las longitudes de flujo de páginas de un pdf (si es posible)

pdftk broken.pdf output fixed.pdf

Separar un único documento en páginas sueltas y escribir los datos del documento a doc_data.txt

pdftk mydoc.pdf burst

Escribir un informe sobre los metadatos, marcadores y etiquetas de página de un PDF

pdftk mydoc.pdf dump_data output report.txt

domingo, 21 de octubre de 2007

Dos vídeos proLinux

Fuente: UbuntuLife

La última batalla. Link a Youtube

Tux & noobs. Link a Youtube

viernes, 19 de octubre de 2007

Los runlevels de Linux

Acrobat Reader 8.1.1 para Linux

Desde la página de Adobe podemos descargarnos esta versión de Linux mejorada. No sé si es por desconocimiento, pero el caso es que en todos los lectores de pdf que he probado en Ubuntu, ninguno me ampliaba más allá del 400%, pero con el Acrobat puedo hasta unos 8000. Tampoco he visto tan a la mano la herramienta de exportar texto en *.txt. De momento solo con estas dos utilidades he visto que mercía hacerle un post, seguiré testeando.

Hasta más ver.

jueves, 18 de octubre de 2007

Ubuntu 7.10, Gusty Gibbon: Lanzado

Ya sabéis qué hacer para actualizar vuestro Ubuntu.

Por tanto, ahora solo os queda predicar la noticia a todas aquellas personas a las que apreciáis, pues como esto de Linux lo hacemos entre todos, debemos promocionarlo entre todos. Así descibrí este espíritu de fraternidad hacia los demás, y así he hecho yo con otra gente.

Esto va más allá de una cadena de favores. Es la expresión más pura del egoísmo: ayudar para ser ayudado.

Id y difundid Linux.

miércoles, 17 de octubre de 2007

Microsoft usa publicidad desesperada contra Linux

Fuente: CesariusRevolutions

Porqué cuando no tienes suficientes argumentos para aniquilar a tu enemigo empiezas a atacarlo con las formas más deshonestas posibles? Esto mismo está pasando con Microsoft, al cuál se está viendo amenazada con el creciente auge de GNU/Linux y especialemente de Ubuntu, además de que en la red no se habla de otra cosa que no sea de la nueva versión que está por lanzarse este 18 de Octubre.

Justamente leyendo acerca de esto, me encuentro con la imagen que ves abajo… sí leyendo una noticia relacionada con el nuevo lanzamiento de Ubuntu encuentro este tipo de publicidad de parte de Microsoft.

La publicidad asquerosa de Microsoft contra Linux

(Clic para agrandar)

Lo único que me queda claro es que sin duda Ubuntu está haciendo temblar a la gente de Redmond y dentro de poco estará reinando los escritorios del planeta… los usuarios no somos estúpidos, ni nos chupamos el dedo, y sabemos diferenciar entre buenos y malos productos, además de que este tipo de practicas solo hablan de lo mal que Microsoft invierte su tiempo, en lugar de estar denigrando a Ubuntu y al mundo de Software Libre en general, deberían utilizar ese tiempo en desarrollar productos de calidad… de esos que siempre han querido tener.

Actualizar Ubuntu

Fuente: UbunteroErrante

Ya está disponible la versión 7.10 de nuestro amado Ubuntu para descargar. Muchos direis, ¿No es el jueves cuando sale? pues sí, pero ya podemos actualizar.

Yo mientras escribo este post estoy actualizando.

Tenemos 2 formas de actualizar:

  • Bajandonos la ISO.
  • Actualizando desde el propio sistema.

Si queremos bajarnos la ISO para luego quemarla debemos irnos a esta dirección que nos ofrecen la versión del día, como ya no van a añadir nada nuevo a la versión definitiva podemos descargarnos la ISO tranquilamente.

Pero si por lo contrario preferimos actualizar desde el sistema tenemos que teclear en una terminal:

update-manager -d

Y se actualizará solito.

Nota: A partir del día 18 si actualizamos desde el sistema debemos quitar el -d quedando:

update-manager

Eso sí, siempre podemos pedir los CD de Ubuntu.

martes, 16 de octubre de 2007

Curso completo de Ubuntu

Fuente: UbuntuLife

El siguiente documento es un curso muy completo de Introduccion a Linux empleando Ubuntu como Sistema operativo de ejemplo. Este curso fue realizado por el Ministerio de Educacion y Ciencia de España, aproximadamente son 17 Mb y al descomprimir obtienes un PDF de 265 paginas.

Contenido:

-Ubuntu en Live CD
-Instalación de Ubuntu
-Sofware libre
-El entorno de trabajo en Ubuntu
-Gestión de archivos
-Administración básica de sistema
-Aplicaciones de red
-Ofimática básica en Ubuntu
-Otras tareas elementales

La parte de instalacion de Ubuntu puede venir muy bien a los usuarios que empiecen pues comenta como instalar ubuntu de manera que conviva con una instalacion de Windows y explicando de manera clara como usar Gparted, la herramienta incluida con ubuntu para realizar las particiones del disco duro.

Enlace de descarga

UNetBootin, instala Linux desd Windows

Fuente: UbuntuLife

Muchas personas tienen problemas a la hora de instalar Linux, especialmente si estan utilizando Windows y llegan a la parte de formatear las particiones, en este punto se paran por miedo a borrar la particion de Windows. Frente a las multiples formas que ya tenemos para instalar Ubuntu ahora se suma una nueva, lo que puede facilitar la vida a las personas que se encuentren en esta situacion.

UNetBootin es un instalador de varias distribuciones de Linux como son: Ubuntu, Fedora, Mandriva, Open Suse, Arch Linux y Debian. Este instalador se puede ejecutar directamente desde Windows o Linux (hay ejecutable para ambas plataformas) y ya se encarga el mismo de descargar la ISO correspondiente e instalarla en un particion o espacio libre que tengamos en nuestro sistema operativo. La ventaja es que la instalacion es automatica, el inconveniente que le veo que has de tener una buena conexion o ancho de banda para descargar la imagen correspondiente.

Sitio oficial

Tutorial de Howto forge para instalar ubuntu usando UNetBootin

lunes, 8 de octubre de 2007

Kirocker: visor fullscreen para Amarok

Soy un melómano y como usuario de Linux que soy escucho música frecuentemente en Amarok. Con Kirocker tendras una interfaz sencilla y agradable para esas largas horas escuchando a tu música preferida.

Fuente: OpenGamer

Kirocker es una aplicacion para Amarok, para reproducir nuestra musica a fullscreen, darle rating y todo con un bello fondo.

Diran, y para que lo quiero?.

Bueno, simplemente esta de lujo en una reunion cuando no quieres que los demas vean que estabas haciendo :-P , en fin.. siempre para estas aplicaciones es cosa de imaginacion para encontrarle una utilidad xD.

En lo personal a mi me gusto bastante

Descargar Kirocker
Version 32 bits Version 64 bits

Para echarlo a correr solo hay que tipear kirocker en el lanzador (alt+F2)
par

sábado, 6 de octubre de 2007

Conexión a cviugr-v2 con Ubuntu Gusty

Fuente: Solo en viernes

Ya se comentó aquí hace algún tiempo el problema para conectarse a la red WPA (cviugr-v2) de la Universidad de Granada. El problema estaba en la versión de NetworkManager que no tenía soporte para phase2, pero Ubuntu Gutsy ya incorpora la versión 0.6.5 y ya se puede conectar. Para los que usen versiones anteriores a Gutsy Gibbon tienen dos opciones: o instalan los paquetes de Gutsy (con sus dependencias) o siguen conectándose mediante script.

Bueno, ahora vamos a la configuración, la cuál resulta muy sencilla:

  1. Tipo de red: WPA empresarial (versión 1)
  2. Método EAP: TTLS
  3. Tipo Phase2: PAP
  4. Identidad: nuestro_usuario@correo.ugr.es
  5. Contraseña: contraseña_de_usuario
  6. Identidad anónima: anonymous@ugr.es

Y con esto todo debería ir como la seda. Aquí dejo una captura, por si es de utilidad.

GrubEd, editor gráfico de la configuración del grub

GrubEd es una herramienta gráfica que nos permite editar muchas de las características de nuestro grub.

Antes de instalar este programa, recomiendo hacer una copia de seguridad de nuestro archivo de configuración por si las moscas. Para ello, tecleamos:

$ sudo cp /boot/grub/menu.lst /boot/grub/menu.lst.backup

Es siguiente paso es descargar el archivo desde aquí y lo guardamos en la carpeta que deseemos.

Descomprimimos y abrimos la carpeta desde un terminal y escribimos:

$ sudo ./instalar

Con esto ya tenemos instalada la aplicación en nuestro sistema, ahora para ejecutar el programa existe dentro de la carpeta un instalador, el cual podemos copiar en el escritorio o ponerlo en nuestro menú de aplicaciones.

Al ejecutarlo, aparecerá una ventana en la cual, podrás editar las siguientes características:

- Ayuda:
Despliega este archivo de ayuda.

- Cambiar el SO de arranque:
Despliega una lista de los Sistemas Operativos instalados disponibles en el menu.lst, doble click en un SO para dejarlo por defecto.

- Ajustar el tiempo de espera:
Esto ajusta el tiempo de espera del Grub. El tiempo de espera es el tiempo en segundos que el grub espera hasta que bootea el SO por defecto, el tiempo de espera se cancela presionando las flechas del teclado, solo se permiten números enteros y positivos, de lo contrario se esperan efectos desconocidos, si deseas deshabilitar esta opción utiliza 'Habilitar / Deshabilitar el tiempo de espera'.

- Habilitar / Deshabilitar el tiempo de espera:
Habilita o deshabilita el tiempo de espera del grub.

- Ocultar / Mostrar Grub:
Oculta o muestra el menú grub, si deseas ocultarlo, este se comportará normalmente, y si lo deseas 'mostrar', solo presiona la tecla 'Esc'.

- Ajustes de Color:
Esta opción te permite habilitar o deshabilitar el color, al igual que los esquemas.
Crear un esquema es simple. Primero seleccionas 2 colores de los NO-SELECCIONADOS, 'Primer plano' es el color del texto y 'Fondo' es el color de fondo, luego seleccionas colores para los SELECCIONADOS, una vez terminado, los cambios se aplicarán.

- Ajustes de imagen de splash:
Esto abre un nuevo menú en el cual puedes habilitar, deshabilitar o elegir la imagen de splash.
Puedes utilizar la imagen de ejemplo o hacer la tuya, y esta DEBE tener las siguientes características:
640x480 pixeles.
solamente debe ser de 14 colores.
formato .xpm.gz.

Aunque la imagen no necesariamente debe estar en .xpm.gz, este script trabaja con ese formato, y cualquier otro te dará un error. Cuando la hayas seleccionado, es mejor copiarla en /boot/grub/images. Aunque igualmente puede estar en cualquier otro lugar, es más rápido y limpio que se encuentre en el lugar correcto.

Al parecer al grub no le gusta este asunto de los colores y el splash, y al tener ambos puede causar conflictos, por lo que te recomiendo que elijas una de los siguientes combinaciones:

Splash habilitado, colores deshabilitados o,
Splash deshabilitado, colores habilitados o,
los dos deshabilitados.

- Habilitar / Deshabilitar memtest86:
En algunos sistemas el 'memtest86' se añade automáticamente al menú. Si no lo quieres así, deshabilítalo y 'Actualizar grub' para que los cambios funcionen.

- Cambia el número de kernels desplegados en el menú:
Con esto ajustas el número de kernels desplegados en el menú.
Por defecto muestra todos (all) los kernels, puedes seleccionar un número, pero si seleccionas '0', est eserá ignorado, ya que seleccionar '0 kernels desplegados' es una mala idea, también puedes utilizar 'all' (todos), cualquier otra opción producirá malos resultados, debes aplicar 'Actualizar
grub' para aplicar los cambios.

- Edición directa:
Esto mostrará tu actual menu.lst, debes tener mucho cuidado y seguir al pie de la letra la indicación para cada función, esta opción es útil si quieres editar algo que no puedas con este script.

- Actualizar Grub:
Lanza el comando preinstalado 'update-grub' que escanea tu sistema en busca de SO y kernels. Es recomendado que respaldes el menu.lst antes de ejecutar esta opción.

- Reiniciar:
Reinicia tu equipo, te pedirá confirmación. No te alarmes si tu pantalla cambia a un termnial, es normal. Y como siempre antes de reiniciar o apagar, guarda y cierra los programas abiertos.

- Respaldo:
Esto creará un respaldo de tu actual grub y lo llamará 'menu.lst.GruBK'.
Es recomendado que utilices esta opción antes de cualquier otra.

- Restaurar:
Esta opción restaurará el grub respaldado, siempre que exista alguno.

Abrir pestaña en consola

Fuente: UbuntuLife

Un pequeño tip que he descubierto para la consola de comandos de gnome: gnome-terminal y que puede venirte muy bien si p.ej conectas a muchas maquinas o sueles tener abiertas muchas pestañas.

Si ejecutas gnome-terminal con el parametro –tab (ojo son 2 guiones) se abre una terminal nueva con una pestaña. Puedes ir añadiendo tantas como quieras:

$ gnome-terminal --tab --tab

Si a esto le añadimos el parametro -e o -x nos permite ejecutar un comando. Por ejemplo:

$ gnome-terminal -e "telnet maquina1" --tab -e "telnet maquina2" --tab -e "telnet maquina3"

abre una consola de terminal con 3 pestañas y en cada una de ellas esta la session de telnet a la maquina remota.

No he conseguido que ejecute comandos que no esperen la introduccion o pulsacion de una tecla, los ejecuta y se cierra el terminal, pero de todas formas puede servirte bien en este ultimo caso, si sueles conectar a otras maquinas remotas mediante telnet o por ejemplo para vigilar la salida de algun fichero (con un tail -f ).

Para la lista completa de comandos que admite gnome-terminal ejecuta:

$ gnome-terminal --help

Por ejemplo el de geometry nos permite colocar la consola en las coordenadas (posicion de pantalla) que queramos.

Gráfico con tu email

Email Icon Generator es una web en la que podras crear un gráfico, diferente para cada servicio de email, en la que se coloca la dirección de email que hayas puesto, un ejemplo:

Email Icon Generator

Soporta 25 proveedores de email y como se puede comprobar el diseño es bastante bonito y útil para evitar que los robots de Spam consigan tu email.

Enlace: Email Icon Generator
Fuente: DosBit

Lectores de feeds de escritorio

Los feeds, al igual que los favoritos, son sagrados. Y hay que guardarlos, ordenarlos y mantenerlos bien. Yo prefiero usar un lector de escritorio en vez de uno online, y he estado buscando opciones para poder elegir. Al final me quedo con el que he usado siempre, pero bueno, ahora sé que hay unos cuantos proyectos más que están evolucionando rápido y con un poco de tiempo van a ser muy buenos.

Ahí va una recopilación con lo que he encontrado y un pantallazo de cada uno para ver el aspecto en general:

Liferea

Pantallazo Liferea

Es el que he usado siempre, y el que voy a seguir usando por ahora. Cuando llegas a un número de feeds elevado se vuelve un poquín lento, pero funciona realmente bien. Integrado en Gnome, muchas funcionalidades y buena organización. Las búsquedas en todos los canales funcionan de maravilla, y se queda minimizado en el área de notificación cuando no lo estás usando. Por ahora, el mejor.

Blam!

Pantallazo Blam!

Desarrollado sobre la plataforma Mono, este lector para Gnome tiene todo lo que puedes necesitar, salvo la organización de feeds por carpetas. Personalmente lo echo de menos, porque cuando estás suscrito a muchos canales tienes que organizarlos de alguna manera. Por lo demás, funciona muy bien y muy rápido.

Straw

Pantallazo Straw

De los que no conocía, es el que más me ha gustado. Integrado en Gnome, con icono en el área de notificación, funciona muy rápido y es muy sencillo. Tampoco permite organizar los canales por carpetas, cosa esencial para mí, por lo que por ahora se queda a un lado. Si continúa por el mismo camino puede llegar a ser un serio aspirante al título, :)

Yarssr

Pantallazo Yarssr

No lo he probado, porque al parecer es un programa que se basa exclusivamente en el icono del área de notificación. Desde él, accedes a tus feeds en un menú desplegable y te muestra los últimos posts. No lo he probado porque es evidente que para muchos canales es impracticable, pero si sólo quieres tener unos pocos puede ser un buen programa.

Akregator

Pantallazo Akregator

Es el lector oficial de KDE. Tiene todas las funcionalidades que se pueden pedir y funciona muy bien. No lo he usado mucho porque no tiene una versión para Gnome, pero sin duda es el más conocido y usado de los lectores para KDE.

Snownews

Pantallazo SnowNews

Este es un regalo especial para los amantes incondicionales del terminal. Es un lector de feeds en modo texto.

Hay otros que no he probado, no he conseguido hacer funcionar o bien son ya proyectos que no se actualizan mucho: RSSOwl, RawDog, Syndigator.

¿Conoces alguno más?

PicPuz: crea puzzle desde fotos

QDvdAuthor: crea tus dvd´s

Seguramente has comprado tu pelicula favorita y la tienes en tu biblioteca de pelis particular. Cuando coges tu pelicula favorita y la introduces en tu lector de DVD, salta el menu principal y te permite seleccionar las pistas que quieres ver, si quieres o no añadir subtitulos o incluso ver algun extra.

¿No te gustaria crear tu propio DVD? ¿Tu propio menu, con tus animaciones o musica?.

Por ejemplo tienes tu serie favorita y quieres guardar cada uno de sus episodios, o los videos de tu boda, o de tu viaje a paris… que se yo.

Pues de eso se trata. de crear la estructura de tu DVD, añadir el menu que quieras, añadir los botones y navegacion, e incluso la musica.

He analizado alguno que otro programa para Linux. En Windows uno de los mejores es DVD Remake. Para Mac, iDVD.

En Linux me quedo con QDvdAuthor. Es genial, te deja insertar imagenes, animaciones, botones animados, efectos, scripts, etc… Creo que seria interesante que colgara un tutorial, ¿no?. Si no me da problemas, lo subire entre la proxima semana y la siguiente.

No es nada complicado utilizar esta aplicacion, te permite seleccionar la imagen de fondo para el menu, añadir los botones o videos de navegacion, insertar capitulos de video, etc… si no voy mal de tiempo en las proximas semanas colgare un tutorial de su manejo.

Os dejo una captura de mi proyecto actual ^_^

qdvdauthor.png

De momento vete instalandotelo:

$ sudo apt-get install qdvdauthor dvd+rw-tools dvd95 dvdauthor devede

Balloonist, crea comics y viñetas

balloonist.jpg

Estaba buscando una aplicacion para crear los bocadillos de una viñeta comica. Habia decidido o crearlos con Inkscape o con Gimp, de hecho encontre un buen tutorial. Pero al final buscando..buscando he dado con Balloonist.

Balloonist es una aplicacion Java que de una manera muy sencilla nos permite crear los bocadillos para una imagen, asi, de esta manera podriamos crear facilmente nuestras propias historietas o comics.

He de advertir que no es software libre, si te gusta tienes que comprarlo y registrarte, pero de todas formas esta disponible para evaluacion. Puedes descargarlo para Mac, Windows y Linux.

En el caso de Linux, descargate el fichero y lo descomprimes. Una vez descomprimido, Para ejecutarlo usa el siguiente comando:

$ java -jar balloonist.jar

(Requiere que tengas instalado las librerias de java runtime en tu maquina).

El programa es muy sencillo de manejar, puedes cargar las imagenes que quieras como fondo de las viñetas y en la parte izquierda de la aplicacion dispones de los diferentes bocadillos. Seleccionas el bocadillo deseado y lo arrastras sobre la imagen. Puedes editar sus propiedades, cambiar el color, la forma, y el texto que incluye el bocadillo. Te animo a probarlo.

mini_pensamientos_de_house.jpg

Si usas photoshop, en esta pagina puedes encontrarte ya muchos “balloons” predefinidos para descargar.

balloons.jpg

Tutorial para crear balloons con Inkscape

Bueno espero vuestros comics !!! ^_^, ahora ya no podeis decir que no…

Distribuciones para bioinformática

He recopilado una serie de distros muy útiles para la bioinformática, yo aún no sé utilizarlas, pero todo se andará.

Fuente: Bioinformática

Hace tiempo que llevo dándole vueltas a la cabeza acerca de cuál es el mejor sistema operativo para hacer bioinformática (aquí se me nota que estudié Ingeniería Informática). Y si os soy sincero, lo único que he sacado en claro es que no es Windows :-) Éste es el primero de una serie de artículos sobre sistemas operativos y bioinformática, e intentaré mencionar los sistemas más representativos.

Much@s de nosotr@s estamos usando distribuciones Linux (Debian/Ubuntu/etc, RedHat/Fedora, SuSE/OpenSuSE, Madrake/Mandriva, Gentoo, etc...), Unix (FreeBSD, Solaris/OpenSolaris, IRIX, Tru64, HP/UX, AIX, ...), Mac OS X, ¡o incluso Windows! Y tod@s nosotr@s, en mayor o menor medida hemos sufrido con los siguientes problemas:

  1. Tras leernos un artículo, hemos querido instalar un programa o librería (por ejemplo, t-coffee o BioPerl), pero como no hay paquetes instalables para nuestro sistema, hemos tenido que compilarlos a mano.
  2. Como estos programas y librerías dependen muchas veces de paquetes que no están en nuestra distribución/sistema operativo, ¡también los hemos tenido que compilar!
  3. Pasa el tiempo, y hemos querido actualizar el sistema operativo, y entonces, ¡se va todo al garete! ¡Vuelta a empezar!
1. Gentoo

Hace un par de años estaba ya totalmente harto de compilar, por todo el tiempo que perdía buscando qué tenía que instalar, probando, etc... Además, también estaba harto de que cada vez que actualizaba el sistema operativo, pudieran surgir problemas entre lo que compilé y lo que se ha actualizado. En ese momento pensé en usar algún sistema operativo con actualizaciones continuas, como alguna variante de Debian Linux, FreeBSD o Gentoo Linux (éstos dos últimos para los radicales entre los radicales). Por curiosidad, me puse a ver qué paquetes había disponibles en Gentoo, y quedé gratamente sorprendido al encontrar muchos relacionados con la bioinformática. Si mirais en:
http://packages.gentoo.org/packages/?category=sci-biology
vereis lo que hay disponible de serie para la biología/bioinformática. Aunque Gentoo Linux es una de las distribuciones más complicadas (todo paquete lo compila el sistema antes de ser instalado), me volví un radical entre los radicales al ver que buena parte del trabajo ya lo tenía hecho, ¡dado que es el sistema y no yo quien tiene que compilar! ¿Alguno de vosotros ha intentado alguna vez instalar molmol? ¡Es una pesadilla hacerlo a mano! ¿Y mantener al día BioPerl o mySQL? Seguro que sí.

Todos los sistemas operativos disponen en mayor o menor medida de un sistema de gestión de paquetes. Casi todos los paquetes disponibles están en formato binario: los programas ya están compilados, y el sistema de paquetes tiene que plantar los ficheros y poco más. Una opción no tan conocida (disponible en casi todas las distribuciones Linux) es la posibilidad de usar paquetes-fuente: sólo contienen las instrucciones de compilación.

Tanto Gentoo Linux como FreeBSD optan por esta alternativa, para preparar los paquetes 'a medida' del sistema que tenemos. El gran inconveniente de este método es el tiempo que pierde el sistema compilando los programas y librerías. ¡Imaginaos cuánto tiempo puede llevar instalar un sistema completo, con todas las herramientas, programas y librerías! ¡Alrededor de una semana! Sin embargo, una vez hecho esto os puedo asegurar que R, BioPerl, NCBI Blast, ClustalW, etc... van a funcionar mejor de lo que pensais.

2. EMBnet

Continuando con la serie de artículos sobre la Bioinformática en su vertiente más 'cacharrera', me he encontrado con que EMBnet genera periódicamente un DVD con un sistema Linux completo. Dicho DVD contiene el software más usado en bioinformática (en todas sus vertientes), preinstalado en el mismo. Lo mejor de todo es que el DVD es Live, lo que permite que puedas usarlo sin necesidad de instalar nada en tu ordenador. La noticia me llegó a través de un correo del reponsable del nodo EMBnet en España, J.R. Valverde:
Hola a todos,

está disponible una nueva versión del DVD 'en vivo' de EMBnet. Quien
desée una copia puede solicitarla (bajando un DVD virgen) en el servicio de
Informática Científica, EMBnet/CNB.

Para usuarios externos, hay una copia disponible en nuestro servidor
WWW y FTP:

ftp://ftp.es.embnet.org/pub/EMBnet/LiveDVD/
http://www.es.embnet.org/Services/ftp/EMBnet/LiveDVD/

El DVD 'en vivo' de EMBnet está disponible solamente para trabajar con
ordenadores PC. Contiene un sistema operativo Linux y una multitud de programas
tanto científicos como de oficina.

Para usarlo basta arrancar el ordenador con el DVD dentro. Al hacerlo
inicia un sistema Linux (independientemente de lo que contenga nuestro PC),
reconoce las particiones de Windows y da acceso a las mismas, y proporciona
acceso a una gran variedad de herramientas configuradas para trabajar
directamente que incluyen

- análisis de secuencias (EMBOSS...)
- análisis de estructura molecular (TINKER, Gromacs, SPDBV...)
- análisis de imagen y geles (ImageJ, GIM...)
- análisis químico (MPQC, PSI3, Ghemical...)
- matemáticas (R, MuPAD, SciLab...)
- software de ofimática (OpenOffice, Ximian Office...)
- servidor Web integrado con portal de trabajo en grupo
- software de videoconferencia

y mucho más.

El DVD 'en vivo' de EMBnet será la herramienta base que usaremos en los
próximos cursos de informática científica.

Muchas de estas herramientas están disponibles también para Mac. Si
necesitáis información, consultad con el servicio de Informática Científica
EMBnet/CNB.

Me lo acabo de descargar para probarlo, y nada más arrancar con él me he encontrado con una agradable sorpresa: ¡está basado en Gentoo! Nada más arrancar, pregunta el kernel que queremos usar. Si teneis problemas con los gráficos al arrancar, os recomiendo que useis 'gentoo-nofb', y en caso contrario, 'gentoo'. En ese momento se inicia el proceso de puesta en marcha del LiveDVD, que consiste en reconocer todos los dispositivos del sistema, autoconfigurar la red y el sonido. A partir de ese instante empieza a arrancar un sistema completo: mysql (bases de datos), apache2 (servidor web), cups (servidor de impresión), entorno gráfico, etc...

He de reconocer que para probarlo lo he sometido a condiciones extremas, porque he usado una máquina virtual creada con qemu para evitar quemar el DVD en cuestión. La máquina virtual era equivalente a un Pentium II con 1.2GHz y 128MB de memoria, y aunque el arranque ha sido muy lento (principalmente por las limitaciones que le he impuesto) ¡ha superado la prueba! Obviamente recomiendo usar un ordenador real, y que dicho ordenador tenga como mínimo 256MB o 512MB de memoria. El principal inconveniente de este LiveDVD es que sólo funciona en los PCs (ya sea con procesadores Intel o AMD), con lo que los usuarios actuales de ordenadores Apple (o arquitecturas más exóticas) quedan fuera.

En definitiva, si teneis miedo a que vuestro ordenador deje de funcionar al instalar Linux y sois usuarios esporádicos de programas bioinformáticos, este LiveDVD puede ser la solución para vosotros, al ser una de las soluciones menos invasivas.

Enlaces relacionados:
3. Bio-Linux

Revisando correos y entradas de blog antiguos, me he encontrado con que prometí hablar hace casi dos años de Bio-Linux, y no lo hice (¡mea culpa!). Además es un buen momento, viendo algunos de los comentarios preguntando dónde encontrar software bioinformático.
Bio-Linux, como muchas distribuciones Linux de hoy en día, está disponible tanto en formato Live-DVD como para instalar en cualquier ordenador. Desde la versión 4.0, esta distribución está basada en Debian, añadiendo muchísimo software bioinformático, tal como se puede consultar en la lista online. Buena parte del software en la lista es:
Todavía no he tenido tiempo de descargarme y evaluar el Live-DVD, pero por lo que contó Jan-Jaap (un compañero de trabajo) está muy bien para temas didácticos, al llevar tantas herramientas bioinformáticas en un solo DVD. Se quejó de que era un poco lento el uso del Live-DVD en portátiles, por tener que estar leyendo cada dos por tres. En cualquier caso, el reconocimiento de hardware funciona bastante bien, porque le reconoció el hardware del portátil sin problemas.

Con este DVD teneis la posibilidad de probar muchas herramientas bioinformáticas sin el engorro de tener que instalarlas. ¡Que lo disfruteis!